病媒生物防制的目標和原則是病媒生物防制的總綱。在一個地區開展該項工作時，防制的目標是將當地病媒生物種群數量控制在不足危害的水平，有條件的部門可力爭達到消滅的目標，以達到消除危害、預防疾病、保障人民身體健康的目的。在防制中必須遵循因地因時制宜，采用以環境治理為主，輔以化學、物理等有效手段與法律、法規、長效管理機制和措施相適應的綜合管理的原則。
一、目 標
鼠疫、流行性出血熱、瘧疾、乙型腦炎、登革熱等許多重要的傳染病是由病媒生物傳播的，許多新發的傳染病如萊姆病、巴爾通體病、裂谷熱、基孔肯雅熱、西尼羅病毒腦炎等也與病媒生物有關，還有部分病媒生物如蜚蠊、鼠和螨等的分泌物、排泄物可導致過敏性哮喘等疾病。病媒生物傳染病除了少部分可通過疫苗免疫接種預防外，大部分需通過病媒生物的防制進行預防和控制。因此病媒生物防制的主要目標是把病媒生物控制在不足為害的水平，以達到消除危害、預防疾病、保障人民健康的目的。
病媒生物除傳播疾病、叮咬、騷擾、引起致敏反應外，還損衣毀物、消耗污染食物，甚至破壞儀器、電路引起火災等對人類正常生活帶來很大影響。隨著社會的發展，生活水平的提高，人們對生活環境質量要求的增高，預防病媒生物的孳生，減少棲息環境，降低其對人群的騷擾，從而達到提高全民生活質量目標的意義更大。
病媒生物綜合管理對城市現代化建設與管理，城鄉一體化有重要促進作用。通過病媒生物綜合管理，促進城市污水溝和河道的整治，廁所的改造與管理，垃圾收運與處理方式的改善，城鄉結合部一體化建設管理，農貿市場和建筑工地管理，食品加工生產企業與飲食業等特殊行業衛生設施完善與管理、城市居民衛生和文明意識的提高，突發疫情、自然災害應急消殺能力建設，對倡導科學合理用藥、保護環境等方面都有明顯作用。
二、原則
病媒生物防制必須堅持綜合管理的原則。
病媒生物防制經歷了三個階段：
①簡單的環境治理階段（前DDT階段）， 1950年以前，主要依靠處理孳生地或使用無機物殺滅幼蟲，降低病媒生物密度；
②化學防制階段，1950~ 1980年，隨著DDT等有機殺蟲劑出現，世界衛生組織開展全球性使用殺蟲劑殺滅媒介按蚊的消滅瘧疾項目，主要是應用室內滯留噴灑，殺滅室內成蟲和通過減少蚊蟲壽命而切斷疾病傳播，這時期病媒生物控制取得很大進展，但隨著害蟲抗藥性高度發展和環境污染問題，化學防制效果也未達到目的；
③1983年WHO引人病媒生物綜合防制（integrated vector con-trol. IVC) 的概念，指出媒介綜合防制是“在經濟合算的情況下，利用各種合適的技術和管理方法，使媒介得到有效的控制”， 確立了綜合防制的原則。陸寶麟院士曾對蚊蟲的綜合治理作進一步的闡述，即“從蚊蟲與環境以及社會條件的整體觀念出發，根據標本兼治而著重治本的原則，因地和因時制宜地對有害蚊種，綜合采用適當的環境治理、化學防制、生物防制或其他有效手段，組合成一套系統的防制措施，通過抑制其發生，降低種群數量或縮短成蚊壽命，把防制種群控制在不足為害的水平，并在有條件的局部地區，爭取予以清除，以達到除害滅病和／或減少吸血騷擾的目的”。